DE BIASE DANIELA

Professore Associato    Vai alla scheda del docente
Settore scientifico disciplinare di riferimento  (BIO/10)
Ateneo Università degli Studi di ROMA "La Sapienza" 
Struttura di afferenza Dipartimento di SCIENZE E BIOTECNOLOGIE MEDICO-CHIRURGICHE 
Recapiti Elenco recapiti telefonici
Fax 0773 1757254
E-Mail daniela.debiase@uniroma1.it
Web https://web.uniroma1.it/dsbmc/en/department/people/associate-professors/de-biase-daniela

Orari di ricevimento

giovedì ore 10-12 (Latina) venerdì ore 14-15 (Roma) E' preferibile contattare preventivamente il docente via e-mail per definire l'orario e quindi evitare attese

Curriculum

Curriculum di studi e accademico di Daniela De Biase
2010- ad oggi: Professore Associato di Biochimica (BIO/10), Sapienza Università di Roma, Dip. di Scienze e Biotecnologie Medico-Chirurgiche (Latina- Polo Pontino);
2010: 1 mese-Professore Visitatore presso Laboratoire de Biologie et Pharmacologie Appliquée - Ecole Normale Supérieure (ENS) de Cachan-France;
2001-2010: Professore Associato di Biochimica (BIO/10), Sapienza Università di Roma, Dip. di Scienze Biochimiche "A. Rossi Fanelli"
1991-2001: Ricercatore, Sapienza Università di Roma, Dip. di Scienze Biochimiche "A. Rossi Fanelli"
1991: Ph.D in Biochemistry, conseguito presso University of Wales, College of Cardiff, Cardiff (UK) (oltre 3 anni di permanenza all'estero);
1987: Laurea in Scienze Biologiche(110/110 e lode) conseguita presso Università degli Studi di Roma "La Sapienza"
1983: Diploma di maturità classica (56/60) conseguito presso il liceo classico statale "Giulio Cesare" di Roma.

Attività didattica in Sapienza (attualmente svolge 17 CFU) ripartiti tra i seguenti corsi:
2018- : 1 CFU in Lingua Inglese II (in Metodologia Preclinica 2), Corso di Laurea in Medicina e Chirurgia "E" (sede Polo Pontino-Latina);
2012-ad oggi: 5 CFU negli insegnamenti di Biochemistry I e II, Corso F-International Medical School (insegnamento ed esami svolti completamente in inglese);
2000-ad oggi: 4 CFU nell'insegnamento di Biochimica I, Corso di Laurea in Medicina e Chirurgia "E" (sede Polo Pontino-Latina);
2012-ad oggi: 1 CFU nell'insegnamento di Chimica e Propedeutica Biochimica, Corso di Laurea in Medicina e Chirurgia "E" (sede Polo Pontino-Latina);
2010-ad oggi: 2 CFU di Biochimica nell'Insegnamento "Basi Molecolari della Vita", Laurea triennale in Fisioterapia "E" (sede di Ariccia);
2008-ad oggi: 2 CFU di Biochimica nell'Insegnamento "Basi Molecolari e Cellulari della Vita", Laurea triennale in Ostetricia "A" (sede Policlinico Umberto I-Roma);
2001-ad oggi: 2 CFU di Biochimica nell'Insegnamento "Basi Molecolari della Vita", Laurea triennale in Logopedia "B" (sede di Ariccia);

Attività Istituzionali di Coordinamento Didattico (sin dalla loro istituzione):
1) Componente del Gruppo del riesame e gruppo AQ del Corso di Laurea in Medicina e Chirurgia "E" (Sapienza sede di Latina);
2) Membro della Commissione Tecnico-Pedagogica (CTP) per il Corso di Laurea in Medicina e Chirurgia "E" (Sapienza sede di Latina);
3) Coordinatore di semestre per il I anno-II semestre nel corso di Laurea in Medicina e Chirurgia "E" (Sapienza, sede di Latina);
4) Coordinatore e Presidente di Commissione d'esame dell'Insegnamento "Basi Molecolari della Vita" Corso di Laurea in Fisioterapia (Sapienza, sede di Ariccia);
5) Coordinatore e Presidente di Commissione d'esame dell'Insegnamento "Basi Molecolari della Vita" Corso di Laurea in Logopedia (Sapienza, sede di Ariccia);
6) Coordinatore e Presidente di Commissione d'esame dell'Insegnamento "Basi Molecolari e cellulari della Vita" Corso di Laurea in Ostetricia (Sapienza, sede Policlinico Umberto I);
7) Coordinatore dell'insegnamento Biochemistry II nel corso di Laurea in Medicine and Surgery "F", International Medical School (Sapienza);
8) Coordinatore dell'insegnamento Biochimica I nel corso di Laurea in Medicina e Chirurgia "E" (Sapienza, sede di Latina);
9) 2012-ad oggi: Membro del Collegio di Dottorato in "Scienze della Vita" ("Life Sciences").
10) 2018: Membro della Commissione di Ateneo "24-CFU" per settore BIO/10 per il riconoscimento dei crediti formativi dei candidati all'insegnamento nelle scuole superiori di I e II grado.
11) 2018: Membro della Commissione "Don't miss your chance-DMYC" per la selezione di laureati stranieri al primo ciclo per l'ammissione a corsi di laurea magistrale in Sapienza.
12) 2018: Membro della Commissione area CUN-05 per l'assegnazione di borse di perfezionamento all'estero per laureati di Sapienza.

Erasmus e Internazionalizzazione:
2018- ad oggi: Membro della Commissione internazionalizzazione della Facoltà di Farmacia e Medicina (area medica; su nomina del Preside)
2017-ad oggi: Coordinatore Accademico della Mobilità Internazionale (CAM) per la Facoltà di Farmacia e Medicina di Sapienza (area Medica; su nomina del Preside);
2017-ad oggi: Membro del Comitato Erasmus Traineeship di Sapienza (comitato interfacoltà);
Erasmus Agreement promoter:
2013-2014: Sapienza-Ecole Normale Supérieure de Cachan (France);
2014-2020: Sapienza-University of Eastern Finland (Kuopio, Finland);
2018-2021: Sapienza - Cardiff University (UK).
2018-2021: Sapienza - Radboud University Nijmegen (Netherlands)
2018-2021: Sapienza - Maribor (Slovenia)

Educazione e training in Ricerca:
1986: Svolge un internato formativo di 6 mesi presso l'Istituto Superiore di Sanità a Roma nel gruppo di Virologia guidato dal Prof. Giovanni Battista Rossi nell'ambito di ricerche sull'HIV/AIDS. Acquisisce competenze nell'isolamento del virus da pazienti e nella coltivazione di linfociti.
1986-1987: Prosegue il suo percorso di formazione nella ricerca lavorando come studente interno in tesi presso il Dip. di Scienze Biochimiche di Sapienza sotto la guida dei Professori Donatella Barra e Francesco Bossa. Si dedica allo studio della determinazione della struttura primaria di proteine e peptidi bioattivi (in collaborazione con il Prof. Vittorio Erspamer) acquisendo competenze in HPLC e utiluzzo di sequenziatori di proteine (gas-phase Edman).
1988-1991: Nell'ambito di un European Project, Human Capital and Mobility (equivalente ad una delle attuali Marie Sklodowska-Curie Actions), si trasferisce per 3 anni a Cardiff (Biochemistry Dept., University of Wales, College of Cardiff, Cardiff (UK)) dove porterà avanti il suo progetto di dottorato su "I meccanismi di inattivazione di enzimi PLP-dipendenti (GABA-transaminasi, ornitina transaminasi) da parte di inibitori basati sul meccanismo". Supervisor: Prof. R.A. John. Durante questo periodo acquisisce competenze nella purificazione dei suddetti enzimi da organi animali e perfeziona le sue conoscenze enzimologiche e di tecniche spettroscopiche (UV-visibile, CD, fluorescenza).
Ha trascorso diversi brevi periodi di ricerca all'estero: Biozentrum (Basel, Switzerland; 1991), IPK (Gatersleben, Germany; 1994), Biochemistry Dpt, Univ College Cardiff (Cardiff, UK; 1995).
Dal 1988 si dedica allo studio dei rapporti struttura funzione in GABA-transaminasi (di mammifero) e glutammato decarbossilasi (batterica e umana).
Dal 1997-ad oggi: studia la regolazione dell'espressione genica in particolare dei geni del sistema gad coinvolti nella risposta allo stess acido estremo nel batterio modello Escherichia coli. In questo periodo espande il suo campo di ricerche alla Fisiologia microbica e allo studio delle interazioni DNA-proteina.
Ad oggi ha laureato più di 30 studenti Master/specialistica (in tesi per 18 mesi) ed è stata supervisor/co-supervisor/tutor di 9 dottorandi.

Pubblicazioni e attività Editoriali e di reviewing:
Daniela De Biase è co-authore di oltre 60 pubblicazioni su riviste e libri a diffusione internazionale (2017 Scopus h-index=23). Ha depositato tre brevetti italiani (con Sapienza).
Daniela De Biase svolge attività di reviewer per molte riviste scientifiche, come ad esempio: Molecular Microbiology, Infection and Immunity, Virulence, Biochemistry, Biotechnology and Bioengeneering, FEBS Journal, Enzyme and Microbial Technology. Questa attività è certificata da Publons: https://publons.com/author/462106/daniela-de-biase#stats.
E' valutatore di progetti per BBSRC (UK), ANR (France) e Università Italo-Francese (UIF).

Membro di Board Editoriale di riviste internazionali:
1) Frontiers in Microbiology (Associate Editor per la Sezione Microbial Physiology and Metabolism) http://journal.frontiersin.org/journal/microbiology/section/microbial-physiology-and-metabolism#editorial-board
2) AIMS Microbiology http://www.aimspress.com/journal/microbiology

Organizzazione di Conferenze Internazionali:
Organizzatore del 2018 EFB meeting “Microbial Stress: from System to Molecules and back” (http://www.efb-central.org/index.php/microbial_stress/)
Organizzatore del 2019 Advanced Course "Trends in enzymology and Biocatalysis” (https://teb2019.azuleon.org/)

Affiliazioni a Società scientifiche :
1989- ad oggi: SIB (Società Italiana di Biochimica e Biologia Molecolare);
2009- ad oggi: ASM (American Society for Microbiology)
2017- ad oggi: Microbiology Society (UK)
2016- ad oggi: Board Member della Microbial Physiology Section dell'European Federation of Biotechnology (EFB), http://www.efb-central.org/index.php/microbialphysiology/C61.

Principali Linee di Ricerca:
Microbiologia-Biologia Molecolare: regolazione trascrizionale e biochimica del sistema Gad, il più potente sistema di acido-resistenza (AR) in Escherichia coli (commensale e pathogeno) e in molti altri batteri enterici.
Interconnessioni tra i differenti sistemi AR e altri processi fisiologici in E. coli ed altri batteri enterici.
Nuove molecole di origine naturale e sintetica come potenziali antibiotici.
Biochimica: Esperto in enzimi PLP-dipendenti, in particolare glutammato decarbossilasi (GAD) e GABA-transaminasi (GABA-T) di origine batterica e di mammifero.
Biotechnologia: Ingegnerizzazione di GAD per applicazioni Biotech.

Finanziamenti per la ricerca come PI (dal 2014):
1) 2013-2015 "Involvement of Escherichia coli acid resistance genes in virulence expression and in the adaptation to changing environmental conditions" Istituto Pasteur- Fondazione Cenci Bolognetti, 3-anni: € 20.000,00/anno;
2) 2014 "Ruolo degli enzimi preposti al metabolismo del GABA in lievito in condizioni di stress, durante l'invecchiamento e nell'apoptosi" Progetto di Ricerca di Università C26A14ZSMB, 1 anno: € 10.000,00;
3) 2015 "Cross-talks between acid resistance and virulence determinants in Enteropathogenic Escherichia coli (EPEC)" Project Galileo n. G14-137, Université Franco-Italienne, 1 anno: € 2.800,00 (solo per mobilità);
4) 2015 "Structure and conformational changes in GadX, a global transcriptional regulator in Escherichia coli" BIOSTRUCTX_9162 BioStruct-X Single Project. Progetto per accedere alle Facilities di PETRA III- Sincrotrone di Hamburg.
5) 2015-2017 " Beyond acid resistance: Role of bacterial γ-aminobutyrate (GABA) in community and host interactions" PROGRAMMES TRANSVERSAUX DE RECHERCHE - PTR 2015 finanziato da Pasteur Institute (Paris, France). PI: Prof Jean-Marc Ghigo al Pasteur; 2 anni: € 246.000,00 (di cui € 112.000,00 al co-PI: Prof. Daniela De Biase).
6) 2017 "Sulfur-containing amino acids and their derivatives: from chemical and bio-based synthesis to the investigation of their biological activities" Progetto di Ricerca di Università RM11715C813C7E84, 1 anno: € 10.000,00;
7) 2018-2019 "Whole transcriptome (RNA-Seq) combined with biochemical studies to evaluate the contribution of the metabolism of glutamate and GABA in Mycobacterium tuberculosis strains circulating in Salvador, Bahia, Brazi" (in collaborazione con l'istituti FIOCRUZ, Brasile) finanziato da Istituto Pasteur- Fondazione Cenci Bolognetti, 2-anni: € 15.000,00/anno;
8) 2018 "Sulfur-containing amino acids and their derivatives: from chemical and bio-based synthesis to the investigation of their biological activities" Progetto di Ricerca di Università RM118164308E05B2, 1 anno: € 10.000,00.

Collaborazioni Internazionali in corso:
Dr. Silvie Rimsky, College de France, Paris, France.
Dr. Alessandra Occhialini, IRIM, University of Montpellier, France.
Dr Alex Khomutov, Engelhardt Institute of Molecular Biology, Russian Academy of Sciences, Moscow, Russia.
prof. Jouko Vepsalainen, School of Pharmacy, University of Eastern Finland, Kuopio, Finland.
Prof. John Blanchard, Albert Einstein, College of Medicine, New York, USA.
Dr. Theolis Barbosa, Fiocruz Institute, Fundacao Oswaldo Cruz, Instutute Pasteur, Brazil.

Seminari su invito (dal 2015):
1. 2016: “Catalytic mechanism and structural organization of Escherichia coli Glutamate Decarboxylase” V Congress of the Russian Biochemical Society- V CIS Congress on Physiology, Sochi – Dagomys, Russia October 4–9, 2016 (invited speaker).
2. 2015: “Acid stress resistance of gut bacteria: characterization of the GadX regulon in Escherichia coli” Collège de France – Paris (seminar upon invitation; November 30, 2015).
3. 2015: “Role of the glutamate decarboxylase (GAD)-dependent system of Brucella spp. in the resistance to extreme acid stress”. Microbial Stress: From Molecules to Systems. Sitges, Spain 12-15 November, 2015 (selected speaker).
4. 2015: “Glutamate decarboxylase from neutralophilic bacteria: from biochemistry, to physiology and biotechnology” The Francis Crick Institute - Mill Hill Laboratory. London, UK; May 7, 2015 (seminar upon invitation)