Catalogo dei Corsi di studio

http://www.farmaciamedicina.uniroma1.it/files/CV/CV_TRAVAGLINI_ALLOCATEL...

Laurea in Biologia (1988; Univ di Roma La Sapienza)
Dottore di Ricerca in Biochimica (1995; Univ di Roma La Sapienza)
Ricercatore CNR Centro sulla Biologia Molecolare - Roma (1996 -1999)
Ricercatore Universitario Dip. Scienze Biochimiche, Univ di Roma La Sapienza (1999-2001)
Professore Associato Dip. Scienze Biochimiche, Univ di Roma La Sapienza (2001- a oggi)
Membro del Collegio dei Docenti della Scuola di Dottorato in Biochimica (Università di Roma La Sapienza)

Attività scientifica
Gli interessi scientifici del Prof. Carlo Travaglini-Allocatelli sono orientati nei campi della Biologia Molecolare e della Biochimica delle proteine con speciale attenzione al problema del folding delle proteine (determinazione dei meccanismi di folding, caratterizzazione strutturale ed energetica degli stati di transizione e di stati intermedi tramite metodiche spettroscopiche all'equilibrio ed in cinetica rapida e super-rapida) e allo studio delle relazioni struttura-funzione di diversi sistemi proteici, sia procariotici che eucariotici.
Pubblicazioni significative

1) Travaglini-Allocatelli C., Gianni, S., Brunori M. (2004) A common folding mechanism in the cytochrome c family.
Trends Biochem. Sci. 29; 535-541.

2) Travaglini-Allocatelli C, Gianni S, Dubey VK, Borgia A, Di Matteo A, Bonivento D, Cutruzzolà F, Bren KL, Brunori M. (2005). An obligatory intermediate in the folding pathway of cyctochrome c552 from Hydrogenobacter thermophilus.
J. Biol. Chem. 280; 25729-34.

3) Gianni S, Calosci N, Aelen JM, Vuister GW, Brunori M, Travaglini-Allocatelli C. (2005).
Kinetic folding mechanism of PDZ2 from PTP-BL.
Prot. Eng. Des. & Selection 18; 389-395.

4) Gianni S, Geierhaas CD, Calosci N, Jemth P, Vuister GW, Travaglini-Allocatelli C, Vendruscolo M, Brunori M. (2007). A PDZ domain recapitulates a unifying mechanism for protein folding.
Proc. Natl. Acad. Sci. USA 104; 128-33

5) Di Matteo A., Gianni S, Schininà ME, Giorgi A, Altieri F, Calosci N, Brunori M, Travaglini-Allocatelli C. (2007). A strategic protein in cytochrome C maturation: 3D structure of CcmH and binding to apocytochrome C.
J. Biol. Chem. 282; 27012-27019.

6) Gianni S, Brunori M, Travaglini-Allocatelli C. (2007) Plasticity of the protein folding landscape: Switching between on- and off-pathway intermediates
Arch. Biochem. Biophys. 466; 172-176.

7) Calosci N., Chi C.N., Richter B., Camilloni C., Engström A., Eklund L., Travaglini-Allocatelli C., Gianni S., Vendruscolo M., Jemth P. (2008) Comparison of successive transition states for folding reveals alternative early folding pathways of two homologous proteins.
Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 105; 19240 45.

8) Travaglini-Allocatelli C., Ivarsson Y., Jemth P., Gianni S. (2009) Folding and stability of globular proteins and implications for function.
Curr. Opin. Struct. Biol. 19; 3-7.

9) Ivarsson Y., Travaglini-Allocatelli C., Brunori M., Gianni S. (2009) Engineered symmetric connectivity of secondary structure elements highlights malleability of protein folding pathways.
J. Am. Chem. Soc. 131; 11727-11733.

10) Di Matteo A., Calosci N., Gianni S., Jemth P., Brunori M., Travaglini-Allocatelli C. (2010) Structural and functional characterization of CcmG from Pseudomonas aeruginosa, a key component of the bacterial cytochrome c maturation apparatus.
Proteins 78; 2213 2221.

11) Gianni S., Ivarsson1 Y., De Simone A., Travaglini-Allocatelli C., Brunori M., Vendruscolo M. (2010) Structural characterization of a misfolded intermediate populated during the folding process of a PDZ domain
Nat. Struct. Mol. Biol. 12; 1431-1437.

12) Morrone A, McCully ME, Bryan PN, Brunori M, Daggett V, Gianni S, Travaglini-Allocatelli C. (2011) The denatured state dictates the topology of two proteins with almost identical sequence but different native structure and function .
J. Biol. Chem. 286; 3863-3872.

13) Giri R, Morrone A, Travaglini-Allocatelli C, Jemth P, Brunori M, Gianni S. (2012) Folding pathways of proteins with increasing degree of sequence identities but different structure and function .
Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 109; 17772-76.

14) Di Silvio E, Di Matteo A, Malatesta F, Travaglini-Allocatelli C. (2013) Recognition and binding of Apocytochrome c to P. aeruginosa CcmI, a component of Cytochrome c maturation machinery .
Biochim. Biophys. Acta, 1834; 1554-61.

15) Petrosino M, Bonetti D, Pasquo A, Lori L, Chiaraluce R, Travaglini-Allocatelli C. (2017) Unveiling the folding mechanism of the Bromodomains
Biochemistry and Biophysics Reports 11; 99-104.

16) Di Matteo A, Franceschini M, Paiardini A, Grottesi A, Chiarella S, Rocchio S, Di Natale C, Marasco D, Vitagliano L, Travaglini-Allocatelli C, Federici L. (2017) Structural investigation of nucleophosmin interaction with the tumor suppressor Fbw7
Oncogenesis 6(9):e379. doi: 10.1038/oncsis.2017.78.

17) Bonetti D, Troilo F, Toto A, Travaglini-Allocatelli C, Brunori M, Gianni S. (2018) The Mechanism of Folding and Binding of the N-Terminal SH2 Domain from SHP2
The Journal of Physical Chemistry Part B, doi: 10.1021/acs.jpcb.8b05651.

18) D. Santorelli, S. Rocchio, F. Fata, I. Silvestri, F. Angelucci, F. Imperi, D. Marasco, C. Diaferia, L. Gigli, N. Demitri, L. Federici, A. Di Matteo, C. Travaglini-Allocatelli (2020) The folding and aggregation properties of a single KH-domain protein: Ribosome binding factor A (RbfA) from Pseudomonas aeruginosa
BBA - General Subjects doi: 10.1016/j.bbagen.2020.129780

19) L. Novak, M. Petrosino, D. Santorelli, R. Chiaraluce, V. Consalvi, A. Pasquo, C. Travaglini-Allocatelli (2021) A glimpse into the structural properties of the intermediate and transition state in the folding of Bromodomain 2 domain 2 by -value analysis
Int. J. Mol. Sciences (IJMS) 22, 5953. doi.org/10.3390/ijms22115953