Docente
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BALLARINO MONICA
(programma)
Programma del Corso Il corso comprende 60 ore di lezioni teoriche, esercitazioni nei database biologici e seminari per studenti.
Evoluzione del concetto di gene: dalle teorie sull’eredità di Darwin all'era post-genomica; il Progetto Genoma Umano. Anatomia dei genomi, dimensione del genoma e numero di geni. Progetti Fantom ed Encode. Il DNA non codificante (ncDNA).
Struttura e replicazione del DNA. Struttura della cromatina e modifiche istoniche. Trascrizione e maturazione dell'mRNA: capping, splicing e poliadenilazione; RNA Factories: accoppiamento tra processi trascrizionali e post-trascrizionali. Splicing alternativo e malattie umane. La traduzione. RNA interference. Principali classi di RNA non codificanti: microRNA (miRNA); RNA lunghi non codificanti (lncRNA), specie nucleari e citoplasmatiche (biogenesi e funzione); RNA circolari (circRNA), biogenesi e funzione. Analisi funzionale di RNA non codificanti nel differenziamento cellulare (miogenesi). Editing genomico: il sistema CRISPR / CAS9. Generazione di modelli murini (Knock-IN / Knock-OUT).
Cenni sulle principali tecnologie per lo studio e la manipolazione di DNA e RNA: marcatura degli acidi nucleici e saggi di ibridazione (Southern/Northern Blot, microarray), PCR, RT-PCR, clonaggio del DNA. Sequenziamento di nuova generazione (NGS) e bioinformatica in biologia molecolare. Approcci genetici e biochimici allo studio dell'interattoma: two-hybrid nel lievito, immunoprecipitazione, co-immunoprecipitazione, tagging proteico e saggi di pull-down. Interazioni di proteine e RNA con la cromatina: i) Immunoprecipitazione della cromatina (ChIP) e ii) Isolamento della cromatina mediante purificazione dell'RNA (ChIRP). Identificazione e studio di domini sub-topologici (TAD): 3C, 4C, 5C, Hi-C e ChIA-PET. Imaging cellulare e tissutale.
Un testo a scelta tra i seguenti: Biologia Molecolare del gene – VII edizione – Watson et al., Ed. Zanichelli Biologia Molecolare – R.F. Weaver – Mc Graw Hill –Il gene X – B. Lewin et al. (Zanichelli)
Per un immediato aggiornamento dei testi o del materiale didattico distribuito dal docente consultare la pagina web del corso: https://elearning2.uniroma1.it
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