Lezioni introduttorie (approssimativamente 4 ore): Principi base della struttura delle proteine e della loro biosintesi 1. Distinzione tra amminoacidi canonici o standard, amminoacidi proteingenici e amminoacidi non canonici; proprietà degli amminoacidi proteinogenici. 2. Meccasimi celulari di biosintesi di catene polipeptidiche (sintesi glutatione, NRPS; ABC della sintesi ribosomiale e il ribozima del centro transpeptidasico) Core curriculare (approssimativamente 16 ore): 3. Relazioni struttura/funzione dei principali motivi strutturali ad alfa elica, a foglietto beta e a composizione mista (principi associativi tra elementi di struttura secondaria, connettività ed elementi di connessione strutturati e destrutturati, principi di topologia proteica) e alcuni esempi di rilevanza biologica. 4. Cenni sul processo di strutturazione delle proteine in vitro e in vivo. 5. Richiami sulle principali tecniche di determinazione e di predizione della struttura tridimensionale delle proteine, di analisi e simulazione del processo di strutturazione. Attività pratiche (approssimativamente 12 ore a studente, suddivisi in "piccoli gruppi"): 6. Descrizione, dimostrazione e esercitazione sulla interrogazione della Banca Dati PDB 7. Descrizione, dimostrazione e esercitazione sull'uso del programma di grafica molecolare PyMol 8. Descrizione, dimostrazione e esercitazione sulla consultazione della banca dati di domini proteici CATH

All'inizio del corso sarà consigliato un unico testo in cui gli studenti potranno approfondire con uno studio individuale i principi della struttura della proteine trattati a lezione. Per favorire la continuità nello studio, e stimolare ad utilizzare anche questo strumento, a lezione sarà utilizzata la componente iconografica dello stesso libro di riferimento. Attualmente il testo in lingua italiana che più si adatta a questo scopo è "Come Funzionano le Proteine", ed. Zanichelli.

Principi base della struttura delle proteine e della loro biosintesi. Relazioni struttura/funzione dei principali motivi strutturali ad alfa elica, a foglietto beta e a composizione mista (principi associativi tra elementi di struttura secondaria, connettività ed elementi di connessione strutturati e destrutturati, principi di topologia proteica) e alcuni esempi di rilevanza biologica. Cenni sul processo di strutturazione delle proteine in vitro e in vivo. Richiami sulle principali tecniche di determinazione e di predizione della struttura tridimensionale delle proteine, di analisi e simulazione del processo di strutturazione, della caratterizzazione di interazioni proteina-proteina in vivo e in vitro. Approfondimento delle relazioni struttura/funzione in sistemi proteici specifici (proteine di membrana, complessi multienzimatici, motori proteici).

Il testo di riferimento è M. Williamson 'Come Funzionano le Proteine', ed. Zanichelli. Altro materiale didattico è pubblicato dal docente nel sito didattico Elearning2 alla pagina web http://elearning2.uniroma1.it