|
Docente
|
GIANSANTI ANDREA
(programma)
Diversi temi e modelli presi dalla biofisica teorica, bioinformatica e genomica strutturale vengono proposti agli studenti sotto forma di problemi biologici da esplorare e risolvere usando programmi di calcolo (in silico) Una lista di temi proposti di recente comprende: dinamica stocastica di reazioni chimiche (algoritmo di Gillespie), codon bias, predittori di disordine intrinseco nelle proteine, clustering superparamagnetico e analysis di componenti principali.
 K.A.Dill & S. Bromberg, Molecular Driving Forces, Garland Science, 2nd ed. 2011.
R. Phillips, J. Kondev, J. Theriot, H. Garcia, Physical Biology of the Cell, 2nd ed. Garland Science (Taylor and Francis), 2012.
R. Phillips & R. Milo, Cell Biology by the Numbers, Garland Science, 2016. (http://book.bionumbers.org ) [W] Waigh_T.A., Applied Biophysics, Wiley, 2007.
M. Griebel, S. Kanpek and G. Zumbusch, Numerical Simulation in Molecular Dynamics, Springer, (2007).
PG Higgs, TK Attwood, Bioinformatics and Molecular Evolution, Blackwell, 2006. Mathematical backbone and proofs
R Durbin, Eddy, Krogh, Michison. Biological Sequence Analysis. CUP, 1999.
S. Bassi, Python for Bioinformatics.2nd Ed. CRC Press, 2018.
|
