Docente
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TRAMONTANO ANNA
(programma)
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Cenni
introduttivi sui sistemi biologici e sulla loro evoluzione.
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Tipologie
di dati biologici: sequenze, strutture, reti e immagini.
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Banche
dati biologiche e biomediche e loro organizzazione.
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Metodi
computazionali per l’analisi di sequenze: programmazione dinamica, profili,
Modelli nascosti di Markov, ricostruzione filogenetica, ricerca di motivi.
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Analisi
di genomi: genomica comparata, analisi di polimorfismi, analisi di associazioni
genetiche, cenni di genetica e dinamica delle popolazioni.
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Metodi
computazionali per l’analisi di strutture: calcolo delle proprietà geometriche
e strutturali, sovrapposizione ottimale, classificazione.
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Predizione
di funzione, struttura e interazioni delle macromolecole biologiche
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Metodi
per l’analisi delle proprietà di reti metaboliche e genetiche.
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Analisi
di immagini: enhancement, filtraggio, segmentazione, riconoscimento di pattern.
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Analisi
integrata dei dati e sue applicazioni.
Dispense - Handouts
Durbin, Eddy, Krogh, Michison Biological Sequence Analysis, Cambridge University Press
Lesk, AM Bioinformatics, Oxford University Press
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